Тезаурус

Метод отношения пика к впадине (peak-to-trough ratio, PTR) — в микробиологии метод, позволяющий оценить темп роста прокариот в исследуемом образце на основе геномных или метагеномных данных. Метод основывается на том факте, что прокариоты в большинстве своем имеют кольцевой геном с фиксированными точками начала и конца репликации. Таким образом, в активно растущей и реплицирующейся популяции можно ожидать большее количество прочтений около сайта начала репликации (пик, peak), чем около сайта конца репликации (впадина, trough). Темп роста оценивается анализом наклона склона между этими двумя точками на графике распределения прочтений.